教員詳細情報

研究分野・キーワード

• 植物栄養学; 土壌学; 分子生物学; 遺伝学; バイオインフォマティクス

学歴

• 2006年03月, 三重大学, 生物資源学部, 資源循環学科, 卒業
• 2008年03月, 三重大学, 大学院生物資源学研究科, 資源循環学専攻, 修士課程・博士前期課程, 修了
• 2011年03月, 三重大学, 大学院生物資源学研究科, 資源循環学専攻, 博士課程・博士後期課程, 修了

職歴

• 2009年04月 - 2011年03月 三重大学大学院生物資源学研究科 日本学術振興会特別研究員
• 2011年04月 - 2012年01月 三重大学大学院生物資源学研究科 研究員
• 2012年02月 - 2013年03月 東京大学大学院農学生命科学研究科 研究員
• 2013年04月 - 2015年04月 東京大学大学院農学生命科学研究科 日本学術振興会特別研究員
• 2015年05月 - 2016年03月 広島大学大学院生物圏科学研究科 助教
• 2016年04月 - 2018年03月 中央大学理工学部 助教
• 2018年04月 - 2019年03月 広島大学大学院生物圏科学研究科 特任准教授
• 2019年04月 - 2019年12月 広島大学大学院統合生命科学研究科 特任准教授
• 2020年01月 - 継続中 佐賀大学農学部 准教授
• 2020年01月 - 9999年99月 広島大学大学院統合生命科学研究科 (兼務） 客員准教授
• 2020年09月 - 9999年99月 鹿児島大学大学院連合農学研究科（兼務） 准教授

専門分野

• 植物栄養学・土壌学

所属学会

• 日本土壌肥料学会, 日本植物生理学会, 日本農芸化学会

受賞歴

• 日本土壌肥料学会2023年度愛媛大会若手口頭発表優秀賞 （2023年09月）
• 第37回日本土壌肥料学会奨励賞 （2019年05月）
• 2015年度日本土壌肥料学会関西支部会・優秀発表賞 （2015年12月）
• 日本土壌肥料学会2015年度京都大会・ポスター賞 （2015年09月）
• 第一回植物の栄養研究会・ポスター賞 （2015年09月）

現在実施している研究テーマ

• mRNAのエキソン構造制御を介した植物の低カリウム応答機構の解明
• 植物の栄養環境に応じた選択的スプライシング制御の分子機構の解明
• 重金属超集積植物における金属タンパク質/金属輸送タンパク質の適応的分子進化の解明

これまでの研究テーマ

• 重金属性不良土壌における食糧生産を目指した重金属低吸収モデル植物の創製
• 環境浄化バイオマス植物の開発を目的とした遺伝子材料の大規模探索
• 植物の土壌環境適応戦略における選択的スプライシングの機能的、進化的解析
• 植物根圏におけるヨウ素還元機構の分析化学的、分子遺伝学的解明

主要業績

• Role of potassium-dependent alternative splicing of MYB59 in maintenance of potassium concentration in shoots of Arabidopsis thaliana 2023年10月
• 植物の低栄養耐性-3：植物の低カリウム耐性 2022年09月
• Aberrant RNA splicing of the phytic acid synthesis gene inositol-1,3,4 trisphosphate 5/6-kinase in a low phytic acid soybean line 2022年08月
• Differences in mineral accumulation and gene expression profiles between two metal hyperaccumulators, Noccaea japonica and Noccaea caerulescens ecotype Ganges, under excess nickel condition 2021年07月
• Exploration of unknown nickel-containing proteins from plants by liquid chromatography–inductively coupled plasma mass spectrometry 2020年00月
• Roles of Non-Coding RNAs in Response to Nitrogen Availability in Plants 2020年00月
• Elevated expression of vacuolar nickel transporter gene IREG2 is associated with reduced root-to-shoot nickel translocation in Noccaea japonica 2020年00月
• 大規模塩基配列解析技術を利用した植物の低栄養条件に対する適応機構の研究 2019年00月
• Genome-wide analysis of long intergenic noncoding RNAs responding to low-nutrient conditions in Arabidopsis thaliana - possible involvement of trans-acting siRNA3 in response to low nitrogen 2019年00月
• 植物の栄養環境に応じた伝令RNAの構造調節 2019年00月
• Monitoring of iodine species during water purification at a public water treatment plant in Japan 2019年00月
• Identification of genomic regions associated with low phosphorus tolerance in japonica rice (Oryza sativa L.) by QTL-Seq 2018年00月
• 生物情報科学・細胞生物学的手法から見えてきた植物栄養応答(6)次世代トランスクリプトーム解析による植物の新しい無機栄養応答機構の探索 2017年00月
• Genome-wide analysis of specific alterations in transcript structure and accumulation caused by nutrient deficiencies in Arabidopsis thaliana 2017年00月
• Enhanced arsenic sensitivity with excess phytochelatin accumulation in shoots of a SULTR1;2 knockout mutant of Arabidopsis thaliana (L.) Heynh 2016年00月
• Induction of nickel accumulation in response to zinc deficiency in Arabidopsis thaliana 2015年00月
• Induction of IRT1 by the nickel-induced iron-deficient response in Arabidopsis 2012年00月
• AtIRT1, the primary iron uptake transporter in the root, mediates excess nickel accumulation in Arabidopsis thaliana 2011年00月
• Identification of the N-terminal region of TjZNT2, a Zrt/Irt-like protein family metal transporter, as a novel functional region involved in metal ion selectivity 2011年00月
• Involvement of histidine-rich domain of ZIP family transporter TjZNT1 in metal ion specificity 2008年00月

原著論文

• Potassium transporter OsHAK17 may contribute to saline-alkaline tolerant mechanisms in rice (Oryza sativa);　2024年10月
  発表情報;　Journal of Plant Research, in press
  著者;　Mami Nampei, Hiromu Ogi, Tanee Sreewongchai, Sho Nishida, Akihiro Ueda
  
• Role of potassium-dependent alternative splicing of MYB59 in maintenance of potassium concentration in shoots of Arabidopsis thaliana;　2023年10月
  発表情報;　Plant and Cell Physiology, 64, 10, 1159–1166
  著者;　Takuo Enomoto, Nobuhiro Tanaka, Toru Fujiwara, Sho Nishida
  
• Glucosinolate catabolism maintains glucosinolate profiles and transport in sulfur-starved Arabidopsis;　2023年00月
  発表情報;　Plant and Cell Physiology
  著者;　Liu Zhang, Ryota Kawaguchi, Takuo Enomoto, Sho Nishida, Meike Burow, Akiko Maruyama-Nakashita
  
• Aberrant RNA splicing of the phytic acid synthesis gene inositol-1,3,4 trisphosphate 5/6-kinase in a low phytic acid soybean line;　2022年08月
  発表情報;　Soil Science and Plant Nutrition, 68, 5-6, 553-562
  著者;　Dong Qin, Sho Nishida, Rumi Tominaga, Akihiro Ueda, Victor Raboy, Hirofumi Saneoka
  
• Ethylene works as a possible regulator for the rootlet elongation and transcription of genes for phosphorus acquisition in cluster roots of Lupinus albus L.;　2022年00月
  発表情報;　Soil Science and Plant Nutrition, 68, 3, 383-392
  著者;　Hirotsuna Yamada, Sho Nishida, Jun Wasaki
  
• Differences in mineral accumulation and gene expression profiles between two metal hyperaccumulators, Noccaea japonica and Noccaea caerulescens ecotype Ganges, under excess nickel condition;　2021年07月
  発表情報;　Plant Signaling and Behavior, e1945212, -, 1-5
  著者;　Takuo Enomoto, Junko Yoshida, Takafumi Mizuno, Toshihiro Watanabe, Sho Nishida
  
• Exploration of unknown nickel-containing proteins from plants by liquid chromatography–inductively coupled plasma mass spectrometry;　2020年00月
  発表情報;　Soil Science and Plant Nutrition, 67, 2, 114-119
  著者;　Sho Nishida, Aimi Takahashi, Lumi Negishi, Michio Suzuki, Naoki Furuta
  
• Roles of Non-Coding RNAs in Response to Nitrogen Availability in Plants;　2020年00月
  発表情報;　International Journal of Molecular Sciences, 21, 22, 8508
  著者;　Makiha Fukuda, Toru Fujiwara, Sho Nishida
  
• Elevated expression of vacuolar nickel transporter gene IREG2 is associated with reduced root-to-shoot nickel translocation in Noccaea japonica;　2020年00月
  発表情報;　Frontiers in Plant Science, 11, 1-11
  著者;　Sho Nishida, Ryoji Tanikawa, Shota Ishida, Junko Yoshida, Takafumi Mizuno, Hiromi Nakanishi, Naoki Furuta
  
• Evaluation of measurement uncertainty in the elemental analysis of sintered silicon carbide using laser ablation in liquid-inductively coupled plasma mass spectrometry with external calibration and isotope dilution;　2019年00月
  発表情報;　Accreditation and Quality Assurance, 24, 5
  著者;　Masahide Fujiwara, Koki Hirosawa, Sho Nishida, Naoko Nonose, Naoki Furuta
  
• Genome-wide analysis of long intergenic noncoding RNAs responding to low-nutrient conditions in Arabidopsis thaliana - possible involvement of trans-acting siRNA3 in response to low nitrogen;　2019年00月
  発表情報;　Plant and Cell Physiology, 60, 9
  著者;　Makiha Fukuda, Sho Nishida, Yusuke Kakei, Yukihisa Shimada, Toru Fujiwara
  
• Monitoring of iodine species during water purification at a public water treatment plant in Japan;　2019年00月
  発表情報;　Water Science and Technology: Water Supply, 19, 2
  著者;　Sho Nishida, Maki Asami, Naoya Ohata, Jun Horigome, Naoki Furuta
  
• Organ-specific allocation pattern of acquired phosphorus and dry matter in two rice genotypes with contrasting tolerance to phosphorus deficiency;　2018年00月
  発表情報;　Soil Science and Plant Nutrition, 64, 3
  著者;　D. M. S. B. Dissanayaka, Sho Nishida, Keitaro Tawaraya, Jun Wasaki
  
• Identification of genomic regions associated with low phosphorus tolerance in japonica rice (Oryza sativa L.) by QTL-Seq;　2018年00月
  発表情報;　Soil Science and Plant Nutrition, 64, 3
  著者;　Sho Nishida, D. M. S. B. Dissanayaka, Soichiro Honda, Yoshiko Tateishi, Masaru Chuba, Hayato Maruyama, Keitaro Tawaraya, Jun Wasaki
  
• Genome-wide analysis of specific alterations in transcript structure and accumulation caused by nutrient deficiencies in Arabidopsis thaliana;　2017年00月
  発表情報;　The Plant Journal, 91, 4
  著者;　Sho Nishida, Yusuke Kakei, Yukihisa Shimada, Toru Fujiwara
  
• Landrace of japonica rice, Akamai exhibits enhanced root growth and efficient leaf phosphorus remobilization in response to limited phosphorus availability;　2017年00月
  発表情報;　Plant and Soil, 414, 1
  著者;　D. M. S. B. Dissanayaka, Hayato Maruyama, Sho Nishida, Keitaro Tawaraya, Jun Wasaki
  
• Enhanced arsenic sensitivity with excess phytochelatin accumulation in shoots of a SULTR1;2 knockout mutant of Arabidopsis thaliana (L.) Heynh;　2016年00月
  発表情報;　Soil Science and Plant Nutrition, 62, 4
  著者;　Sho Nishida, Guilan Duan, Naoko Ohkama-Ohtsu, Shimpei Uraguchi, Toru Fujiwara
  
• Large-scale profiling of brown rice ionome in an ethyl methanesulphonate-mutagenized hitomebore population and identification of high- and low-cadmium lines;　2016年00月
  発表情報;　Plant and Soil, 407, 1
  著者;　Nobuhiro Tanaka, Sho Nishida, Takehiro Kamiya, Toru Fujiwara
  
• A decrease in phytic acid content substantially affects the distribution of mineral elements within rice seeds;　2015年00月
  発表情報;　Plant Science, 238
  著者;　Hiroaki Sakai, Toru Iwai, Chie Matsubara, Yuto Usui, Masaki Okamura, Osamu Yatou, Yasuko Terada, Naohiro Aoki, Sho Nishida, Kaoru T. Yoshida
  
• Induction of nickel accumulation in response to zinc deficiency in Arabidopsis thaliana;　2015年00月
  発表情報;　International Journal of Molecular Sciences, 16, 5
  著者;　Sho Nishida, Aki Kato, Chisato Tsuzuki, Junko Yoshida, Takafumi Mizuno
  
• Overexpression of a gene involved in phytic acid biosynthesis substantially increases phytic acid and total phosphorus in rice seeds;　2015年00月
  発表情報;　Plants, 4, 2
  著者;　Yusuke Tagashira, Tomoe Shimizu, Masanobu Miyamoto, Sho Nishida, Kaoru T. Yoshida
  
• Two distinct families of protein kinases are required for plant growth under high external Mg2+ concentrations in Arabidopsis;　2015年00月
  発表情報;　Plant Physiology, 167, 3
  著者;　Junro Mogami, Yasunari Fujita, Takuya Yoshida, Yoshifumi Tsukiori, Hirofumi Nakagami, Yuko Nomura, Toru Fujiwara, Sho Nishida, Shuichi Yanagisawa, Tetsuya Ishida, Fuminori Takahashi, Kyoko Morimoto, Satoshi Kidokoro, Junya Mizoi, Kazuo Shinozaki, Kazuko Yamaguchi-Shinozaki
  
• Selective induction of putative iron transporters, OPT8a and OPT8b, in maize by mycorrhizal colonization;　2014年00月
  発表情報;　Soil Science and Plant Nutrition, 60, 6
  著者;　Yoshihiro Kobae, Rie Tomioka, Keitaro Tanoi, Natsuko I. Kobayashi, Yoshihiro Ohmori, Sho Nishida, Toru Fujiwara
  
• The effect of fertilization on cesium concentration of rice grown in a paddy field in Fukushima Prefecture in 2011 and 2012;　2014年00月
  発表情報;　Journal of Plant Research, 127, 1
  著者;　Yoshihiro Ohmori, Masataka Kajikawa, Sho Nishida, Nobuhiro Tanaka, Natsuko I. Kobayashi, Keitaro Tanoi, Jun Furukawa, Toru Fujiwara
  
• Difference in cesium accumulation among rice cultivars grown in the paddy field in Fukushima Prefecture in 2011 and 2012;　2014年00月
  発表情報;　Journal of Plant Research, 127, 1
  著者;　Yoshihiro Ohmori, Yayoi Inui, Masataka Kajikawa, Atsumi Nakata, Naoyuki Sotta, Koji Kasai, Shimpei Uraguchi, Nobuhiro Tanaka, Sho Nishida, Takahiro Hasegawa, Takuya Sakamoto, Yuko Kawara, Kayoko Aizawa, Haruka Fujita, Ke Li, Naoya Sawaki, Koshiro Oda, Ryuichiro Futagoishi, Takahiro Tsusaka, Satomi Takahashi, Junpei Takano, Shinji Wakuta, Akira Yoshinari, Masataka Uehara, Shigeki Takada, Hayato Nagano, Kyoko Miwa, Izumi Aibara, Takuya Ojima, Kaoru Ebana, Satoru Ishikawa, Kuni Sueyoshi, Hiroshi Hasegawa, Tetsuro Mimura, Mari Mimura, Natsuko I. Kobayashi, Jun Furukawa,Daisuke Kobayashi, Toshiyasu Okouchi, Keitaro Tanoi, Toru Fujiwara
  
• Epigenetic regulation of organic anion transporting polypeptide 1B3 in cancer cell lines;　2013年00月
  発表情報;　Pharmaceutical Research, 30, 11
  著者;　Satoki Imai, Ryota Kikuchi, Yuri Tsuruya, Sotaro Naoi, Sho Nishida, Hiroyuki Kusuhara, Yuichi Sugiyama
  
• New insights into the role of Arabidopsis RABA1 GTPases in salinity stress tolerance;　2013年00月
  発表情報;　Plant Signal and Behavior, 8, 9
  著者;　Rin Asaoka, Tomohiro Uemura, Sho Nishida, Toru Fujiwara, Takashi Ueda, Akihiko Nakano
  
• Induction of IRT1 by the nickel-induced iron-deficient response in Arabidopsis;　2012年00月
  発表情報;　Plant Signal and Behavior, 7, 3
  著者;　Sho Nishida, Ayaka Aisu, Takafumi Mizuno
  
• AtIRT1, the primary iron uptake transporter in the root, mediates excess nickel accumulation in Arabidopsis thaliana;　2011年00月
  発表情報;　Plant and Cell Physiology, 52, 8
  著者;　Sho Nishida, Chisato Tsuzuki, Aki Kato, Ayaka Aisu, Junko Yoshida, Takafumi Mizuno
  
• Identification of the N-terminal region of TjZNT2, a Zrt/Irt-like protein family metal transporter, as a novel functional region involved in metal ion selectivity;　2011年00月
  発表情報;　FEBS Journal, 278, 5
  著者;　Sho Nishida, Yasuhiro Morinaga, Hitoshi Obata, Takafumi Mizuno
  
• Involvement of histidine-rich domain of ZIP family transporter TjZNT1 in metal ion specificity;　2008年00月
  発表情報;　Plant Physiology and Biochemistry, 46, 5
  著者;　Sho Nishida, Takafumi Mizuno, Hitoshi Obata
  
• Investigation of the basis for Ni tolerance conferred by the expression of TjZnt1 and TjZnt2 in yeast strains;　2007年00月
  発表情報;　Plant Physiology and Biochemistry, 45, 5
  著者;　Takafumi Mizuno, Koji Usui, Syo Nishida, Takanori Unno, Hitoshi Obata
  

資料・解説・論説・研究報告・総合雑誌の論文

• オミックス技術が切り開く土壌肥料学: 1. 「オミックス科学」×「土壌肥料学」の新展開;　2023年06月
  発表情報;　日本土壌肥料学雑誌, 94, 3, 208-209
  著者;　西田　翔, 信濃卓郎
  
• 植物の低栄養耐性-3：植物の低カリウム耐性;　2022年09月
  発表情報;　化学と生物, 60, 9, 467-473
  著者;　西田　翔
  
• 大規模塩基配列解析技術を利用した植物の低栄養条件に対する適応機構の研究;　2019年00月
  発表情報;　日本土壌肥料学雑誌, 90, 5
  著者;　西田 翔
  
• 植物の栄養環境に応じた伝令RNAの構造調節;　2019年00月
  発表情報;　アグリバイオ, 3, 4
  著者;　西田 翔
  
• 生物情報科学・細胞生物学的手法から見えてきた植物栄養応答(6)次世代トランスクリプトーム解析による植物の新しい無機栄養応答機構の探索;　2017年00月
  発表情報;　日本土壌肥料学雑誌, 88, 3
  著者;　西田 翔