教員詳細情報

研究分野・キーワード

• 分子生物学

学歴

• 1988年03月, 京都大学, 農学部, 食品工学科, 卒業
• 1990年03月, 京都大学, 農学研究科, 食品工学専攻, 修士課程・博士前期課程, 修了
• 1993年03月, 京都大学, 農学研究科, 食品工学専攻, 博士課程・博士後期課程, 修了

職歴

• 1994年04月 - 1997年02月 滋賀医科大学医学部 助手
• 1997年03月 - 1999年03月 名古屋大学農学部 助手
• 1999年04月 - 2002年10月 名古屋大学大学院生命農学研究科 助手
• 2002年11月 - 2007年03月 佐賀大学総合分析実験センター 助教授
• 2005年04月 - 2007年03月 鹿児島大学大学院連合農学研究科（兼務） 助教授
• 2007年04月 - 継続中 佐賀大学総合分析実験センター 准教授
• 2007年04月 - 9999年99月 鹿児島大学大学院連合農学研究科（兼務） 准教授

専門分野

• 応用生物化学, 園芸科学, 応用分子細胞生物学, ゲノム生物学, 食生活学

所属学会

• 日本農芸化学会, 園芸学会, 日本分子生物学会, 日本生化学会, 日本植物バイオテクノロジー学会, 日本植物生理学会, 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム, 日本生物工学会, 日本藻類学会, 日本応用藻類学会, 研究・イノベーション学会

現在実施している研究テーマ

• ゲノム・トランスクリプトーム解析
• 高等植物の生体分子受容機構

これまでの研究テーマ

• 高効率遺伝子組換え法

主要業績

• Identification of genes regulated by lipids from seaweed Susabinori (Pyropia yezoensis) involved in the improvement of hepatic steatosis: Insights from RNA-Seq analysis in obese db/db mice 2023年12月
• RAD-Seq analysis of wild Japanese garlic (Allium macrostemon Bunge) growing in Japan revealed that this neglected crop was previously actively utilized 2023年09月
• Characterization and organelle genome sequencing of Pyropia species from Myanmar 2023年09月
• The role of oceanic currents in the dispersal and connectivity of the mangrove Rhizophora mangle on the Southwest Atlantic region 2023年05月
• Efficient method for generating citrus hybrids with polyembryonic Satsuma mandarin as the female parent 2022年08月
• Classification of Japanese Pepper (Zanthoxylum piperitum DC.) from Different Growing Regions Based on Analysis of Volatile Compounds and Sensory Evaluation 2022年08月
• Genetic diversity of loquat (Eriobotrya japonica) revealed using RAD-Seq SNP markers 2022年06月
• Genomic diversity of 39 samples of Pyropia species grown in Japan 2021年06月
• Genetic diversity and population structure of razor clam Sinonovacula constricta in Ariake Bay, Japan, revealed using RAD-Seq SNP markers. 2021年04月
• Elucidation of Japanese pepper (Zanthoxylum piperitum De Candolle) domestication using RAD-Seq 2021年03月
• Construction of a high-density linkage map for bronze loquat using RAD-SeqConstruction of a high-density linkage map for bronze loquat using RAD-Seq 2019年03月
• Phylogenetic relationships of Aurantioideae (Rutaceae)based on RAD-Seq 2018年01月
• Transcriptome analysis reveals key roles of AtLBR-2 in LPS-induced defense responses in plants. 2017年12月
• RAD-Seq analysis of typical and minor Citrus accessions, including Bhutanese varieties 2016年11月
• Arabidopsis LBP/BPI related-1 and-2 bind to LPS directly and regulate PR1 expression 2016年06月
• Complete Genome Sequence of Bacillus thuringiensis Serovar Tolworthi Strain Pasteur Institute Standard 2015年07月
• Characterization of limes (Citrus aurantifolia) grown in Bhutan and Indonesia using high-throughput sequencing. 2014年04月
• Phylogenetic Relationships of Citrus and Its Relatives Based on matK Gene Sequences. 2013年04月
• Ultra-Low Background DNA Cloning System 2013年02月
• Direct Binding of a Plant LysM Receptor-like Kinase, LysM RLK1/CERK1, to Chitin in Vitro 2010年01月
• Yeast-based recombineering of DNA fragments into plant transformation vectors by one-step transformation 2007年
• Highly efficient yeast-based in vivo DNA cloning of multiple DNA fragments and the simultaneous construction of yeast/ Escherichia coli shuttle vectors. 2006年01月

原著論文

• Identification of genes regulated by lipids from seaweed Susabinori (Pyropia yezoensis) involved in the improvement of hepatic steatosis: Insights from RNA-Seq analysis in obese db/db mice;　2023年12月
  発表情報;　PLOS ONE, 18, 12, e0295591
  著者;　Sayaka Iizasa Koji Nagao, Keisuke Tsuge, Yukio Nagano, Teruyoshi Yanagita
  
• RAD-Seq analysis of wild Japanese garlic (Allium macrostemon Bunge) growing in Japan revealed that this neglected crop was previously actively utilized;　2023年09月
  発表情報;　Scientific Reports, 13, 16354, 1-14
  著者;　Wiwit Probowati, Shogo Koga, Kentaro Harada, Yukio Nagano, Atsushi J. Nagano, Kanji Ishimaru, Kazusato Ohshima & Shinji Fukuda
  
• Characterization and organelle genome sequencing of Pyropia species from Myanmar;　2023年09月
  発表情報;　Scientific Reports, 13, 15677, 1-16
  著者;　Myat Htoo San, Yoshio Kawamura, Kei Kimura, Eranga Pawani Witharana, Takeshi Shimogiri, San San Aye, Thu Thu Min, Cherry Aung, Moe Moe Khaing & Yukio Nagano
  
• Citrus Genetic Resources Grown in Yunnan Province, China;　2023年06月
  発表情報;　Tropical Agriculture and Development, 67, 2, 47 － 53
  著者;　Xuehu YANG, Akira KITAJIMA, Yukio NAGANO, and Masashi YAMAMOTO
  
• The role of oceanic currents in the dispersal and connectivity of the mangrove Rhizophora mangle on the Southwest Atlantic region;　2023年05月
  発表情報;　Molecular Ecology Resources
  著者;　André Guilherme Madeira, Yoshiaki Tsuda, Yukio Nagano, Takaya Iwasaki, Maria Imaculada Zucchi, Tadashi Kajita, Gustavo Maruyama Mori
  
• Efficient method for generating citrus hybrids with polyembryonic Satsuma mandarin as the female parent;　2022年08月
  発表情報;　Molecular Breeding, 42, 51, 1-15
  著者;　Takahiro Noda, Kaoru Daiou, Takashi Mihara, Hisao Murakami, Yukio Nagano
  
• Classification of Japanese Pepper (Zanthoxylum piperitum DC.) from Different Growing Regions Based on Analysis of Volatile Compounds and Sensory Evaluation;　2022年08月
  発表情報;　Molecules, 27, 15, 4946
  著者;　Kazuaki Yamasaki, Nami Fukutome, Fumiyo Hayakawa, Nobuo Ibaragi, Yukio Nagano
  
• Genetic diversity of loquat (Eriobotrya japonica) revealed using RAD-Seq SNP markers;　2022年06月
  発表情報;　Scientific Reports volume 12, Article number: 10200 (2022), 12
  著者;　Yukio Nagano, Hiroaki Tashiro, Sayoko Nishi, Naofumi Hiehata, Atsushi J. Nagano & Shinji Fukuda
  
• Weekly Observations of Estuarine Microbial Assemblages during Summer in the Inner Part of Ariake Bay, Japan; Microbial Water-sediment Coupling in Turbid Shallow Waters;　2022年06月
  発表情報;　Microbes and Environments, 37, 2, Microbes and Environments
  著者;　Ryo Orita, Kazuhiro Yoshida, Hiroto Terazono, Yukio Nagano, Masatoshi Goto, Kei Kimura, Genta Kobayashi
  
• Draft Genome Sequences of Two Antimicrobial Compound-Producing Strains of Bacillus Species, TM-R and SY1-1;　2022年02月
  発表情報;　Microbiology Resource Announcements, 11, 2, e01010-21
  著者;　Noriko Ryuda, Takashi Someya, Yukio Nagano
  
• Development of Monascus purpureus monacolin K-hyperproducing mutant strains by synchrotron light irradiation and their comparative genome analysis;　2022年01月
  発表情報;　Journal of Bioscience and Bioengineering
  著者;　Sittichoke Ketkaeo, Yukio Nagano, Shuichiro Baba, Kei Kimura, Taiki Futagami, Werasit Sanpamongkolchai, Genta Kobayashi, Masatoshi Goto
  
• Potential application of simple easy-to-use insertion-deletion (InDel) markers in citrus cultivar identification;　2021年10月
  発表情報;　Breeding Science
  著者;　Takahiro Noda, Kaoru Daiou, Takashi Mihara, Yukio Nagano
  
• Genomic diversity of 39 samples of Pyropia species grown in Japan;　2021年06月
  発表情報;　PLOS ONE, 16, e0252207, 1-22
  著者;　Yukio Nagano, Kei Kimura, Genta Kobayashi, Yoshio Kawamura
  
• Breeding sake yeast and identification of mutation patterns by synchrotron light irradiation;　2021年06月
  発表情報;　Journal of Bioscience and Bioengineering, 1-6
  著者;　Shuichiro Baba, Tomohiro Hamasaki, Kazutaka Sawada, Ryo Orita, Yukio Nagano, Kei Kimura, Masatoshi Goto, Genta Kobayashi
  
• Genetic diversity and population structure of razor clam Sinonovacula constricta in Ariake Bay, Japan, revealed using RAD-Seq SNP markers.;　2021年04月
  発表情報;　Scientific Reports, 11, 7761, 1-9
  著者;　Ryo Orita, Yukio Nagano, Yoshio Kawamura, Kei Kimura, Genta Kobayash
  
• Elucidation of Japanese pepper (Zanthoxylum piperitum De Candolle) domestication using RAD-Seq;　2021年03月
  発表情報;　Scientific Reports, 11, 6464, 1-16
  著者;　Maddumage Dona Ginushika Priyadarshani Premarathne, Nami Fukutome, Kazuaki Yamasaki, Fumiyo Hayakawa, Atsushi J. Nagano, Hisataka Mizuno, Nobuo Ibaragi, Yukio Nagano
  
• Draft Genome Sequences of Three Strains of Pseudomonas syringae pv. eriobotryae, a Pathogen Causing Canker Disease in Loquat, Isolated in Japan;　2021年01月
  発表情報;　Microbiology Resource Announcements, 10, 1, e01049-20
  著者;　Hiroaki Tashiro, Yukio Nagano, Ayaka Jiromaru, Ryunosuke Sakaguchi, Naofumi Hiehata, Shinji Fukuda
  
• Development of Indel markers for the selection of Satsuma mandarin (Citrus unshiu Marc.) hybrids that can be used for low-cost genotyping with agarose gels;　2020年06月
  発表情報;　, 216, 115
  著者;　Takahiro Noda . Kaoru Daiou . Takashi Mihara . Yukio Nagano
  
• Evaluation of the population structure and phylogeography of the Japanese Genji firefly, Luciola cruciata, at the nuclear DNA level using RAD-Seq analysis;　2020年01月
  発表情報;　Scientific Reports, 10, Article number: 1533
  著者;　Dai-ichiro Kato, Hirobumi Suzuki, Atsuhiro Tsuruta, Juri Maeda, Yoshinobu Hayashi, Kazunari Arima, Yuji Ito & Yukio Nagano
  
• Efforts to enhance safety measures for CRISPR/Cas-based gene drive technology in Japan;　2019年10月
  発表情報;　Journal of Environment and Safety
  著者;　Toshinori Tanaka, Nobukazu Tanaka, Yukio Nagano, Hirotaka Kanuka, Daisuke S. Yamamoto, Natsuko Yamamoto, Eiji Nanba, Takumi Nishiuchi
  
• Construction of a high-density linkage map for bronze loquat using RAD-SeqConstruction of a high-density linkage map for bronze loquat using RAD-Seq;　2019年03月
  発表情報;　Scientia Horticulturae, 251, 59-64
  著者;　Shinji Fukuda, Yukio Nagano, Kimitaka Matsuguma, Keiichiro Ishimoto, Naofumi Hiehata, Atsushi J.Nagano, Ayumi Tezuka, Toshiya Yamamoto
  
• Genetic diversities and population structures of four popular Myanmar local cattle breeds;　2018年10月
  発表情報;　Animal Science Journal, 89, 1648-1655
  著者;　Moe Lwin, Su Lai Y Mon, Hayate Yamanaka, Yukio Nagano, Hideyuki Mannen, Mohammad O Faruque, Kotaro Kawabe, Shin Okamoto, Takeshi Shimogiri
  
• Genetic diversity of Myanmar cattle breeds using complete mitochondrial D-loop sequenc;　2018年08月
  発表情報;　The Journal of Animal Genetics, 46, 57-67
  著者;　Moe LWIN, Su Lai Yee MON, Yukio NAGANO, Kotaro KAWABE, Hideyuki MANNEN, Shin OKAMOTO, Takeshi SHIMOGIRI
  
• Phylogenetic relationships of Aurantioideae (Rutaceae)based on RAD-Seq;　2018年01月
  発表情報;　Tree Genetics & Genomes 14:6 (2018)
  著者;　Yukio Nagano, Takashi Mimura, Nobuhiro Kotoda,Ryoji Matsumoto, Atsushi J. Nagano, Mie N. Honjo, Hiroshi Kudoh, Masashi Yamamoto
  
• Transcriptome analysis reveals key roles of AtLBR-2 in LPS-induced defense responses in plants.;　2017年12月
  発表情報;　BMC Genomics 18:995 (2017)
  著者;　Sayaka Iizasa, Ei'ichi Iizasa, Keiichi Watanabe, Yukio Nagano
  
• RAD-Seq analysis of typical and minor Citrus accessions, including Bhutanese varieties;　2016年11月
  発表情報;　Breeding Science, 66, 797-807
  著者;　Tshering Penjor, Takashi Mimura, Nobuhiro Kotoda, Ryoji Matsumoto, Atsushi J. Nagano, Mie N. Honjo, Hiroshi Kudoh, Masashi Yamamoto, Yukio Nagano
  
• Arabidopsis LBP/BPI related-1 and-2 bind to LPS directly and regulate PR1 expression;　2016年06月
  発表情報;　Scientific reports, 6, 27527
  著者;　Sayaka Iizasa, Ei'ichi Iizasa, Sawako Matsuzaki, Hiroyuki Tanaka, Yutaka Kodama,Keiichi Watanabe, and Yukio Nagano
  
• Complete Genome Sequence of Bacillus thuringiensis Serovar Tolworthi Strain Pasteur Institute Standard;　2015年07月
  発表情報;　, 3, 4, e00710-15
  著者;　Kohzo Kanda, Kaede Nakashima, Yukio Nagano
  
• Characterization of chloroplast matK sequences of Citrus tachibana and Citrus depressa, two indigenous species in Japan;　2014年12月
  発表情報;　Advances in Horticultural Science, 28, 2, 95-99
  著者;　Yukio Nagano, Sayuri Inafuku-Teramoto, Misako Hashimoto, Takashi Mimura, Ryoji Matsumoto, Masashi Yamamoto
  
• ブータン王国における在来カンキツ類の調査とその葉緑体DNA分析;　2014年10月
  発表情報;　園芸学研究, 13, 4, 307-314
  著者;　Tshering Penjor, 永野幸生, 三村高史, 松本亮司, 山本雅史
  
• Characterization of limes (Citrus aurantifolia) grown in Bhutan and Indonesia using high-throughput sequencing.;　2014年04月
  発表情報;　Scientific Reports, 4, 4853
  著者;　Tshering Penjor, Takashi Mimura, Ryoji Matsumoto, Masashi Yamamoto, Yukio Nagano
  
• Phylogenetic Relationships of Citrus and Its Relatives Based on matK Gene Sequences.;　2013年04月
  発表情報;　PLoS ONE, 8, 4, e62574
  著者;　Tshering Penjor, Masashi Yamamoto, Miki Uehara, Manami Ide, Natsumi Matsumoto, Ryoji Matsumoto, Yukio Nagano
  
• Ultra-Low Background DNA Cloning System;　2013年02月
  発表情報;　PLOS ONE, 8, 2, e56530
  著者;　Kenta Goto, Yukio Nagano
  
• Phylogenetic relationships of Citrus and its relatives based on rbcL gene sequences;　2010年12月
  発表情報;　Tree Genetics & Genomes, 6, 6, 931-939
  著者;　Tshering Penjor, Toyoaki Anai, Yukio Nagano, Ryoji Matsumoto and Masashi Yamamoto
  
• Direct Binding of a Plant LysM Receptor-like Kinase, LysM RLK1/CERK1, to Chitin in Vitro;　2010年01月
  発表情報;　THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 285, 5, 2996-3004
  著者;　飯笹英一、光富勝、永野幸生
  
• Yeast-based recombineering of DNA fragments into plant transformation vectors by one-step transformation;　2007年
  発表情報;　Plant Cell Reports, 26, 12, 2111-2117
  著者;　Yukio Nagano, Syoko Takao, Takahiro Kudo, Ei'ichi Iizasa, Toyoaki Anai
  
• Highly efficient yeast-based in vivo DNA cloning of multiple DNA fragments and the simultaneous construction of yeast/ Escherichia coli shuttle vectors.;　2006年01月
  発表情報;　Biotechniques, 40, 1, 79-83
  著者;　Ei'ichi Iizasa, Yukio Nagano
  

資料・解説・論説・研究報告・総合雑誌の論文

• ゲンジボタルの遺伝的多様性を解き明かす;　2022年06月
  発表情報;　昆虫と自然2022年6月号, 57, 7, 19-23
  著者;　加藤 太一郎・鈴木 浩文・永野 幸生